Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNCBQ16143 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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