Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA6Q15825 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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