Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CEBPEQ15744 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms