Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ALX1Q15699 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALX1Q15699 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms