Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms