Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
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RYR3Q15413 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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RYR3Q15413 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RYR3Q15413 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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