Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE4AQ14139 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
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