Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTCH1Q13635 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
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