Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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PEX6Q13608 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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PEX6Q13608 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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PEX6Q13608 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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PEX6Q13608 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
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PEX6Q13608 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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PEX6Q13608 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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PEX6Q13608 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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PEX6Q13608 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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PEX6Q13608 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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PEX6Q13608 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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PEX6Q13608 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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