Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
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TCOF1Q13428 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
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TCOF1Q13428 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
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TCOF1Q13428 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
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