Protein–RNA interactions for Protein: Q13395

TARBP1, Probable methyltransferase TARBP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP1Q13395 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TARBP1Q13395 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TARBP1Q13395 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms