Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP3B2Q13367 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
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AP3B2Q13367 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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AP3B2Q13367 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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AP3B2Q13367 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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AP3B2Q13367 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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