Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF5Q13243 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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