Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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