Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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