Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms