Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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FOXF2Q12947 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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FOXF2Q12947 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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FOXF2Q12947 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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