Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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