Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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