Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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CHD3Q12873 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD3Q12873 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD3Q12873 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD3Q12873 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD3Q12873 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD3Q12873 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CHD3Q12873 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD3Q12873 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD3Q12873 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD3Q12873 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD3Q12873 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD3Q12873 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD3Q12873 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD3Q12873 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CHD3Q12873 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CHD3Q12873 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD3Q12873 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CHD3Q12873 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CHD3Q12873 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CHD3Q12873 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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CHD3Q12873 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CHD3Q12873 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CHD3Q12873 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CHD3Q12873 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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