Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CGNL1Q0VF96 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms