Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDR1Q08345 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms