Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms