Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.65
ERCC6Q03468 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ERCC6Q03468 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms