Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 ZSWIM7-209ENST00000486655 726 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AC024267.5-201ENST00000579154 599 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 STARD13-AS-240ENST00000609608 865 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 BCAS2P3-201ENST00000416374 767 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AC140125.3-202ENST00000504362 348 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AC138965.1-201ENST00000509329 348 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AC105999.2-203ENST00000521030 663 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 NUDT4-205ENST00000548662 765 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 MYL12A-207ENST00000579226 947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms