Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms