Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPEQ02224 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms