Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms