Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms