Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK17Q00537 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms