Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRB1P82279 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRB1P82279 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRB1P82279 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRB1P82279 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRB1P82279 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CRB1P82279 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CRB1P82279 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRB1P82279 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRB1P82279 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CRB1P82279 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRB1P82279 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CRB1P82279 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRB1P82279 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRB1P82279 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRB1P82279 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRB1P82279 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRB1P82279 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRB1P82279 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRB1P82279 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRB1P82279 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRB1P82279 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRB1P82279 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CRB1P82279 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRB1P82279 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRB1P82279 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CRB1P82279 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CRB1P82279 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CRB1P82279 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRB1P82279 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRB1P82279 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRB1P82279 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRB1P82279 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRB1P82279 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRB1P82279 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRB1P82279 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRB1P82279 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRB1P82279 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRB1P82279 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRB1P82279 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRB1P82279 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRB1P82279 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRB1P82279 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CRB1P82279 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CRB1P82279 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRB1P82279 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CRB1P82279 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRB1P82279 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRB1P82279 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRB1P82279 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CRB1P82279 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CRB1P82279 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRB1P82279 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRB1P82279 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRB1P82279 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRB1P82279 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRB1P82279 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CRB1P82279 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRB1P82279 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRB1P82279 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRB1P82279 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRB1P82279 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRB1P82279 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CRB1P82279 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRB1P82279 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRB1P82279 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRB1P82279 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRB1P82279 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRB1P82279 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRB1P82279 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRB1P82279 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRB1P82279 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRB1P82279 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRB1P82279 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CRB1P82279 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRB1P82279 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRB1P82279 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRB1P82279 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRB1P82279 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CRB1P82279 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRB1P82279 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRB1P82279 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRB1P82279 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CRB1P82279 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CRB1P82279 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRB1P82279 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB1P82279 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB1P82279 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB1P82279 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB1P82279 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB1P82279 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB1P82279 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB1P82279 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB1P82279 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB1P82279 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB1P82279 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB1P82279 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB1P82279 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB1P82279 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB1P82279 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms