Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL8P80075 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL8P80075 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL8P80075 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL8P80075 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL8P80075 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL8P80075 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL8P80075 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL8P80075 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL8P80075 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL8P80075 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL8P80075 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL8P80075 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL8P80075 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL8P80075 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL8P80075 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL8P80075 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL8P80075 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL8P80075 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL8P80075 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL8P80075 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL8P80075 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL8P80075 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL8P80075 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL8P80075 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL8P80075 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL8P80075 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL8P80075 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL8P80075 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL8P80075 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL8P80075 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL8P80075 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL8P80075 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL8P80075 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL8P80075 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL8P80075 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL8P80075 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL8P80075 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL8P80075 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL8P80075 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL8P80075 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL8P80075 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL8P80075 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL8P80075 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL8P80075 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL8P80075 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL8P80075 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL8P80075 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL8P80075 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL8P80075 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL8P80075 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL8P80075 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL8P80075 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL8P80075 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL8P80075 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL8P80075 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL8P80075 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL8P80075 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL8P80075 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL8P80075 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL8P80075 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL8P80075 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL8P80075 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL8P80075 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL8P80075 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL8P80075 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL8P80075 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL8P80075 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL8P80075 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL8P80075 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL8P80075 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL8P80075 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL8P80075 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL8P80075 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL8P80075 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL8P80075 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL8P80075 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL8P80075 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL8P80075 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL8P80075 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL8P80075 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL8P80075 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL8P80075 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL8P80075 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL8P80075 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL8P80075 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL8P80075 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL8P80075 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL8P80075 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL8P80075 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL8P80075 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL8P80075 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL8P80075 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL8P80075 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms