Protein–RNA interactions for Protein: P78552

IL13RA1, Interleukin-13 receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL13RA1P78552 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
IL13RA1P78552 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms