Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms