Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF3P57682 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLF3P57682 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLF3P57682 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLF3P57682 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLF3P57682 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF3P57682 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF3P57682 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF3P57682 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF3P57682 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF3P57682 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF3P57682 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF3P57682 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF3P57682 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF3P57682 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF3P57682 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF3P57682 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF3P57682 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF3P57682 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF3P57682 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF3P57682 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF3P57682 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF3P57682 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF3P57682 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF3P57682 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF3P57682 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF3P57682 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF3P57682 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF3P57682 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF3P57682 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF3P57682 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF3P57682 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF3P57682 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF3P57682 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF3P57682 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms