Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AFDNP55196 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AFDNP55196 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AFDNP55196 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFDNP55196 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFDNP55196 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFDNP55196 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFDNP55196 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AFDNP55196 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AFDNP55196 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFDNP55196 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFDNP55196 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFDNP55196 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFDNP55196 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFDNP55196 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFDNP55196 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFDNP55196 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFDNP55196 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFDNP55196 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFDNP55196 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFDNP55196 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFDNP55196 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFDNP55196 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AFDNP55196 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFDNP55196 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFDNP55196 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AFDNP55196 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFDNP55196 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFDNP55196 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFDNP55196 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFDNP55196 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFDNP55196 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFDNP55196 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
AFDNP55196 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
AFDNP55196 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AFDNP55196 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AFDNP55196 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
AFDNP55196 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AFDNP55196 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AFDNP55196 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AFDNP55196 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AFDNP55196 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AFDNP55196 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AFDNP55196 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AFDNP55196 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AFDNP55196 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFDNP55196 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFDNP55196 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFDNP55196 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AFDNP55196 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AFDNP55196 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFDNP55196 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AFDNP55196 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFDNP55196 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFDNP55196 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFDNP55196 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFDNP55196 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFDNP55196 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFDNP55196 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFDNP55196 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFDNP55196 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFDNP55196 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFDNP55196 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFDNP55196 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFDNP55196 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFDNP55196 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFDNP55196 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AFDNP55196 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFDNP55196 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFDNP55196 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFDNP55196 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFDNP55196 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFDNP55196 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AFDNP55196 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFDNP55196 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFDNP55196 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFDNP55196 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFDNP55196 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFDNP55196 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFDNP55196 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFDNP55196 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFDNP55196 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFDNP55196 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFDNP55196 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AFDNP55196 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFDNP55196 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFDNP55196 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFDNP55196 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFDNP55196 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFDNP55196 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFDNP55196 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFDNP55196 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFDNP55196 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
AFDNP55196 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFDNP55196 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFDNP55196 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFDNP55196 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFDNP55196 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFDNP55196 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFDNP55196 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms