Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTTPP55157 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTTPP55157 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTTPP55157 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTTPP55157 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTTPP55157 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTTPP55157 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MTTPP55157 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MTTPP55157 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTTPP55157 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTTPP55157 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTTPP55157 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTTPP55157 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTTPP55157 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTTPP55157 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTTPP55157 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTTPP55157 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTTPP55157 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTTPP55157 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTTPP55157 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTTPP55157 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTTPP55157 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTTPP55157 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MTTPP55157 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTTPP55157 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTTPP55157 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTTPP55157 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTTPP55157 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTTPP55157 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTTPP55157 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTTPP55157 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTTPP55157 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTTPP55157 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTTPP55157 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTTPP55157 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTTPP55157 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTTPP55157 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTTPP55157 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTTPP55157 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTTPP55157 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTTPP55157 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTTPP55157 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTTPP55157 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MTTPP55157 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MTTPP55157 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTTPP55157 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTTPP55157 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTTPP55157 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MTTPP55157 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MTTPP55157 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MTTPP55157 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTTPP55157 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTTPP55157 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTTPP55157 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTTPP55157 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTTPP55157 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTTPP55157 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTTPP55157 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTTPP55157 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTTPP55157 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTTPP55157 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTTPP55157 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms