Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms