Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP3P50461 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms