Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms