Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms