Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTGER3P43115 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTGER3P43115 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms