Protein–RNA interactions for Protein: P36980

CFHR2, Complement factor H-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR2P36980 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR2P36980 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms