Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms