Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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HOXD13P35453 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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HOXD13P35453 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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