Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1AP35321 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms