Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP6P35125 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP6P35125 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
USP6P35125 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP6P35125 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP6P35125 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP6P35125 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP6P35125 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP6P35125 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP6P35125 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP6P35125 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP6P35125 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP6P35125 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP6P35125 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP6P35125 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP6P35125 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP6P35125 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP6P35125 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP6P35125 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP6P35125 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP6P35125 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP6P35125 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
USP6P35125 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP6P35125 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP6P35125 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP6P35125 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP6P35125 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP6P35125 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP6P35125 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP6P35125 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP6P35125 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP6P35125 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP6P35125 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP6P35125 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP6P35125 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP6P35125 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
USP6P35125 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP6P35125 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP6P35125 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP6P35125 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP6P35125 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP6P35125 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP6P35125 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP6P35125 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP6P35125 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP6P35125 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP6P35125 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP6P35125 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP6P35125 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP6P35125 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP6P35125 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP6P35125 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP6P35125 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP6P35125 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP6P35125 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP6P35125 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP6P35125 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP6P35125 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP6P35125 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP6P35125 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP6P35125 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP6P35125 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP6P35125 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP6P35125 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP6P35125 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP6P35125 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP6P35125 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USP6P35125 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP6P35125 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP6P35125 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP6P35125 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP6P35125 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP6P35125 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP6P35125 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP6P35125 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP6P35125 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP6P35125 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP6P35125 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
USP6P35125 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP6P35125 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP6P35125 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP6P35125 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP6P35125 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP6P35125 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP6P35125 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP6P35125 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP6P35125 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
USP6P35125 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
USP6P35125 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP6P35125 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP6P35125 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP6P35125 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP6P35125 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
USP6P35125 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP6P35125 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP6P35125 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP6P35125 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP6P35125 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP6P35125 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP6P35125 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms