Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms