Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRMP28827 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
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