Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms